Nº1 HOSPITALTEC

Terapias Avanzadas Mejora en el diagnóstico genético: secuenciación de genoma frente al exoma Un estudio reciente, publicado en New England Journal of Medicine (Wojcik et al., 2024), mostró la capacidad mejorada de la secuenciación de genoma frente al exoma, concluyendo que la secuenciación mediante WGS permite el diagnóstico de un 8% de pacientes adicionales a la secuenciación de exomas. Este método es especialmente útil cuando las variantes genéticas responsables de una enfermedad no se encuentran en las regiones codificantes del ADN, que es lo que analiza el exoma, sino en regiones no codificantes o intrónicas profundas, las cuales solo pueden ser detectadas mediante la secuenciación del genoma completo. Los análisis de exoma y genoma completo mediante tecnologías de lecturas cortas indican una elevada capacidad diagnóstica, sin embargo, únicamente permitieron identificar variantes causales en el 30% de familias con sospecha de patologías genéticas. Esta limitación puede deberse la presencia de variantes complejas, regiones especialmente repetitivas, variantes estructurales, expansiones de repeticiones en tándem y variantes no codificantes intrónicas profundas que no pueden detectarse de manera fiable mediante la batería de análisis genéticos disponibles actualmente en laboratorios de diagnóstico clínico. 64 N º 1 Avances en la secuenciación de tercera generación Impulsada por la necesidad de superar estas restricciones, han surgido varias aproximaciones de secuenciación de tercera generación que permiten analizar regiones del genoma en tiempo real produciendo lecturas completas de hasta 100 veces más largas que las tecnologías de lectura corta. La secuenciación de lecturas largas está entrando en la práctica clínica permitiendo analizar segmentos que oscilan entre 10kb y 100kb. Esto facilita significativamente el ensamblaje y alineamiento de las regiones de ADN con respecto al genoma de referencia, mejorando notablemente la resolución y permitiendo una correcta asociación de estas regiones con su ubicación adecuada. TECNOLOGÍA SANITARIA

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